As cirurgias craniofaciais infantis podem tratar casos como fenda lábiopalatina, sequência de Pierre Robin, síndrome de Treacher Collins, síndrome de Apert, síndrome de Crouzon e outras condições que causam alterações na posição dos maxilares e dos dentes.
A cirurgia ortognática é realizada numa fase posterior, geralmente quando os pacientes atingem a maturidade esquelética. No entanto, é possível realizar a cirurgia ortognática em estágios mais precoces, a depender da gravidade do problema.
A cirurgia ortognática deve sempre ser realizada em conjunto com o tratamento ortodôntico, posicionando adequadamente os dentes para permitir uma cirurgia adequada.